La MVE estructuró 5 Comisiones de trabajo para conseguir sus objetivos:

Comisión de AVI+10, cordina, promociona y visibiliza conjuntamente con los miembros de la Mesa la actividad voluntaria en el marco del Día Internacional del Voluntariado (DIV 2011), y en el marco del Décimo Aniversario del Año Internacional del Voluntariado (AIV+10).

Comisión de Políticas Públicas, impulsa procesos que faciliten la articulación del voluntariado a las políticas públicas, entre ellas la aprobación oficial de la Ley del Voluntariado en Ecuador y su anteproyecto.

Comisión de Proyectos y Alianzas Estratégicas, fortalece iniciativas conjuntas de los miembros de la Mesa de Voluntariado en el Ecuador, vinculando además nuevos actores al trabajo voluntario como las empresas (voluntariado corporativo) y universidades (voluntariado universitario).

Comisión de Gestión de Conocimiento, trabaja en la generación de evidencia sobre el apoyo del voluntariado para el desarrollo.

Comisión de Comunicación, coordina estrategias de comunicación que permitan socializar al Voluntariado para el Desarrollo en Ecuador y promociona el Día Internacional del Voluntariado - 5 de diciembre.